일시: 5/27(목) 16시
연사: 박성희 (숭실대학교 생명정보학과) Seunghee Park (Dept. of Bioinformatics and Life Sciences, Soongsil U.)
제목: Single-Cell Transcriptome analysis of Immune Cell repertoire in Breast Cancer
내용:
유방암세포 주위에 모여 있는 종양침윤림프구(TIL: Tumor-Infiltering Lymphocytes)에 따라 암의 예후 및 항암치료 반응성과 밀접한 관련성이 있음이 보고되었다. 최근들어, 단일세포 시퀸싱 기술의 발전으로 단일 세포 수준에서 면역세포를 분류할 수 있고 TIL의 침윤정도에 따라 면역 세포에서 차등적 발현 유전자 동정 및 각 세포의 특징에 관한 연구가 가속화되어지고 있다. 그리하여, 이 연구에서는 유방암 개인 면역프로파일을 해석하기 위한 단일세포 전세체 분석 파이프라인을 소개하고 분석에 사용되는 매개변수 섭동(parameter perturbation) 테스트를 통해 향상된 파이프라인을 제시한다. 향상된 파이프라인을 이용하여 종양침윤림프구와 연관성을 보이는 면역 셀타입과 차등적 발현을 보이는 유전자를 살펴본다. 향후 연구로는 단일세포 전사체 실험시 셀들의 위치정보가 손실 된다는 단점을 보완할 수 있는 공간전사체(spatial Transcritome)의 분석으로, 이에 대한 소개로 강연을 마무리한다.